シーケンシングによって(神経)細胞の繋がり方・投射様式を調べる方法について。Zadorラボから報告されているMAPseq等の手法を一通りおさらいした後、Quintanaラボから報告されたRABID-seq論文を紹介。(収録:5/15)
From Kebschull et al., bioRxiv 10.1101/054312v2 (2016)
続きを読む →#11 Sequencing the Connectome
#10 Retrospection of Engrams
ゲスト回を振り返ってEngramについて雑談したり、最近目にした面白い論文をフラッシュトーク的に紹介しあったりしました。(収録:4/24)
続きを読む →#9 Social Interaction with Dr. Teruhiro Okuyama – Part 2
奥山輝大さん（@Teru_Okuyama）ゲスト回後編。メダカ論文の裏話、利根川進先生と一緒に研究をすること、LOF/GOF一辺倒の研究に対して思うこと、などをお話しいただきました。
続きを読む →#8 Social Interaction with Dr. Teruhiro Okuyama – Part 1
東大定量研の奥山輝大さん（@Teru_Okuyama）をゲストに迎え、大学院時代、ポスドク時代、キャリア選択の際に考えていたこと、新PIとしての３年間についてお話しいただきました。後編(Part2)に続きます。
続きを読む →#6 You can (not) watch the movie
雑談回。エヴァ(観てない)、シン・ゴジラ、ボストンの海鮮、ワクチン、ヘイトクライム等について。
続きを読む →#5 Mapping the spatial transcriptomics
10000種類以上のmRNAをsubcellular resolutionで解析できそうなSpatial transcriptomicsの手法について、宮脇が５つの原理に分けて簡単にレビュー。
From Alon et al., bioRxiv 2020.05.13.094268 (2020)
続きを読む →#4 What is cell-type? – Transcriptome meets neurophysiology
ニューロンの細胞種はどう定義されるのか？萩原が in vivo Caイメージングとspatial transcriptomicsを組み合わせた研究２報を紹介しながら議論。トランスクリプトーム回の前編。
from Condylis et al., bioRxiv 2021.02.23.432355 (2021)
続きを読む →#3 Covid19 dominates everything
パンデミックの影響に関して雑談。ヨーロッパでロックダウンの影響をもろに受けた萩原と、パンデミック下にオンラインポスドクインタビュー・ボストン留学開始を経験した宮脇がそれぞれ雑感を話しています。
続きを読む →#2 The grid cells are a torus
論文紹介#1。”グリッド細胞の集合的な活動がドーナツ型になる” ことを示したプレプリントについて話しています。
from Gardner, Hermansen et al., bioRxiv 2021.02.25.432776 (2021)
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