Baylor College of Medicineの山本慎也さんがゲスト。前編。ツールとしてハエを使うNeuroscientistと脳を見ているハエGeneticistの違い、ハエForward geneticsからヒト希少疾患研究に繋がった経緯、Living test tubeとしてのハエの魅力、Reverse geneticsによるヒト化ハエのRare disease・Common disease・感染症研究への応用について (3/28収録)
Show Notes:
- 山本さんラボHP(更新が滞りがち) LinkedIn
- ベイラー医科大学
- 羊土社の留学に関する本
- 動物育種繁殖学教室
- 今川和彦先生
- 着床現象は種特異的
- 臍帯形成などに異常があるVps26a(Hβ58)の変異マウス 1 2
- Hugo Bellen
- Jan and Dan Duncan Neurological Research Institute
- Hugoによるレビュー
- Scott Emr
- 武田洋幸先生
- 多羽田哲也先生
- 後藤聡先生
- Retromer ComplexとWnt signalingに関する論文(４本じゃなくて５本でした：Dev Cell x3 + NCB x2) 1 2 3 4 5
- Gerry Rubin
- Allan Spradling
- Thomas Cech
- Seymour Benzer追悼記事 1 2
- Thomas Hunt Morgan
- ハエ研究の黎明期
- メンデルによる遺伝子の提唱と再発見
- 津田梅子先生がMorganのところでやった仕事
- メンデルの法則
- Hermann Muller
- 放射線による遺伝子の破壊・改変を発見
- Marie Curieの死因
- 発生生物学者と遺伝学者は仲が悪かった
- 最初のNotchミュータントの欠けている翅
- HomozygousだとNeurogenic phenotype
- AntennapediaとUltrabithorax
- ハエの記憶に関する最初の報告
- この系をつかった最初のL&Mの変異体、dunceの論文(cAMPの分解酵素)
- サーカディアンリズムのperiod変異体の論文
- ShibireはDynaminに関する変異体
- Kir2.1
- NaChBac
- 遺伝学的手法を用いてハエの神経活動を操作する(リンク先Table2)
- GSAによるショウジョウバエの学会
- CSHLのNeurobiology of Drosophila
- Janeliaのconference
- NRでショウジョウバエを扱った回
- Forward genetics(順遺伝学)とReverse genetics(逆遺伝学)
- Chemical mutagenesisではEMSやENUがよく用いられる
- armadillo (arm)＝ハエのβ-Catenin
- Christiane Nüsslein-Volhard
- Eric Wieschaus
- The Heidelberg screen回顧録
- MARCM
- 利根川先生のCaMKII-Creを用いたconditional KO (訂正：CaMKIIをcKOしたんじゃなくて、CaMKII-Creを用いて別の遺伝子をcKOしてましたね。 by 山)
- Flp/FRTとEMSを組み合わせることによるモザイク・スクリーニングの初出論文 レビュー
- ハエのElectroretinogram(ERG) 1 2
- ｍusashiとハエの感覚毛の４細胞感覚ユニット
- 岡野先生らによるmusashi発見
- 博士の時にやったスクリーニング
- 結果をヒト希少疾患と結びつけたCell論文
- ApoE2とE4: 逆でした (by 山)
- ヒトゲノム計画におけるBaylorの貢献
- HapMap project
- 1000 Genomes project
- Center for Mendelian Genomics
- Richard Gibbs
- James Lupski
- Synteny(シンテニー)
- Complementation test(相補性検定)
- LiqunのMARCM EMS Screenの例
- Hippo signaling pathway レビュー
- このPathwayのコアのhippoという遺伝子は４つのラボで同時期にFLP/FRTスクリーニングなどを通じてみつかりました（Cell２本、NCB２本） 1 2 3 4
- ハエのin vivo RNAiのライブラリ 1 2 3
- RNAiとEMSで見えてくる遺伝子が違う：Cell論文のFig. 2
- CRISPRも含めて、Mammalの例 1 2
- Rett Syndromeの原因遺伝子はMECP2
- Huda Zoghbi
- ハエ遺伝子のヒト化
- T2A-GAL4
- Kozak-GAL4
- Mutationの機能的分類(Muller’s morphs)
- Undiagnosed Diseases Network(UDN)
- NIH Commonfund
- BRAIN initiative
- UDN Model Organisms Screening Center
- AMEDのIRUD
- IRUDにおける非哺乳類モデルの活用
- IRF2BPLのNeurological phenotypeについて報告した論文
- Paul Marcogliese
- ハエの翅を見るだけでシグナル系の異常かがわかる（リンク先論文Fig6参照）
- WntとIRF2BPL、神経変性疾患の関連を報告した論文
- Simons Foundation のSFARI
- Simons Simplex Collection
- 自閉症とde novo変異の関係を明らかにしたNature論文 1 2 3
- AlphaMissense
- SIFT
- PolyPhen-2
- 共同でラボを運営しているMichael Wangler
- GLRA2と自閉症の関連について報告したCell Reports論文
- GeneMatcher
- 36人に1人は自閉症
- Syndromic autism
- アルツハイマー病のrisk variantの研究 1 2
- ハエを用いた感染症研究
- Nevan Krogan
- ZikaでGBS
- Zikaで小頭症 (microcephaly、脳が小さくなることが問題となる病気なので放送では小脳症と言ってますね。by 山)
- ZikaのNS4AとANKLE2の関連について報告したCell論文
- NS4A以外も調べたDMM論文
- NIHやNSFがCOVID-19研究に金を出すと言い出した
- AddGeneのSARS-CoV-2リソース
- COVIDに適用したCell Reports論文
- NevanのSARS-CoV-2論文
- ORIP
- Actinのariginylation
- 今後アメリカのファンディングの重点がシフトしそう
- ショウジョウバエの全脳マップ 1 2 3
Editorial Notes:
- お招きいただきありがとうございました！とても楽しかったです。マニアックな話をたくさんしてしまった気がしますが、少しでもハエ研究の魅力が伝われば嬉しく思います。後編もぜひお付き合いください(山)
- 釣れてきたかわいい遺伝子から意外なストーリーが作り上げられていくのめっちゃ楽しそうです (脇)
- スクリーニングみたいなhypothesis freeなことをやるにはやはりHHMI最強…こういう”人”につく予算枠組みがもう少しあるといいのに (萩)
